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R3.6.1安裝Bioconductor包新的安裝方法

時間:2019-08-19 16:59來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
R3.6.1更新之后,很多R包安裝方法改變了
install.packages("ggplot2")

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("edgeR")

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")

視頻學習:


R3.6.1軟件下載地址:
鏈接:https://pan.baidu.com/s/1AGtP7Uqv_rLP8hLjK6d-ew
提取碼:i8wx


修改之前是這樣的:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("edgeR")
R包安裝不了常見的錯誤:
1、R軟件安裝位置不對,因每臺電腦硬件不同,建議安裝在默認的C盤,并且在安裝的時候,文件夾不要用空格或者特殊字符,否則安裝R包經常出錯
2、安裝的工作目錄沒有權限,那么要找到R安裝的工作目錄,設置所有用戶的所有權限
3、查看R的版本,盡量更新到最新版,因為R在一臺電腦可以同時安裝多個版本,所以舊版可以先不卸載,安裝一個最新版
4、網絡問題,建議用電信,其他寬帶進外網確實阻力很大。如果網速不好,R都下載不完整,那根本安裝不了的

然后再試下一次,下載完整,可以了:

5、如果以上方法還不行,可以考慮重啟電腦試下。如果還是不行,可以把R包的zip文件下載到本地,嘗試本地安裝
6、再不行,就只能換個電腦試試了,有時候電腦32或者64位對R包安裝也會產生影響。




責任編輯:樂偉
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