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被忽視的SEER數據庫可以挖寶

時間:2019-07-31 11:20來源:原創 作者:森莘 點擊:
有很多學員問,GEO數據庫發文確實簡單,但是分值都很低;TCGA數據庫越來越深入,可以發到高分文章,但在寫在發表的太多,隨便一問都是在挖掘TCGA;那么有沒有一個數據量大,不容易

有很多學員問,GEO數據庫發文確實簡單,但是分值都很低;TCGA數據庫越來越深入,可以發到高分文章,但在寫在發表的太多,隨便一問都是在挖掘TCGA;那么有沒有一個數據量大,不容易出現重復,而且發文相對比較簡單的數據庫呢?

答案是肯定的,SEER數據庫

專門保存癌癥臨床數據的數據庫,應該是你迷茫之際的黃金庫。

 

SEER數據庫給大家準備了三門課程:

《SEER數據庫基礎分析》

《SEER競爭風險模型多原發癌Joinpoint軟件繪圖》

《SEER數據庫列線圖》

有學員就說,這個SEER數據庫我也不懂,也沒有接觸過,該怎么快速學習了解一下SEER數據庫呢?

老師當然會給大家準備好一些短文,讓大家10分鐘快速鏈接SEER數據庫

生信自學SEER板塊:http://www.zmllko.live/SEER/

了解之后,學員就非常想知道,SEER數據庫挖掘適合誰用,發文現狀如何?

既然SEER數據庫是癌癥臨床數據庫,那么對于臨床的醫生、學生、導師,是最佳選擇了,如果研究是癌癥方向,那么發SEER的文章也是非常不錯的選擇;還有就是急著要畢業了,苦于沒有好的研究課題,這個時候就可以和導師商量是否可以研究這樣一個方向,開明的導師當然會給出合理的意見。

方向解決了,現在可以看看,SEER挖掘現在主要作哪些挖掘呢?

對于臨床數據庫,統計是最主打的,幾個高大上的統計表格是每篇論文都會出現的:

再來一個統計表:


接下來是圖:


怎么就可以了嗎?這個自己想象,現在很多論文就是這個幾個點的分析,就可以發到不錯的文章,SEER數據庫的數據庫量是非常龐大的,有很多參數可以選擇,很多數據可以篩選,所以出現重復的概率是很小的,這下不用擔心像TCGA那樣被人提前分析了。

當然還有加分點:

更重要的是,這些分析我們已經錄制好課程,寫好了代碼,就等著學員們去挖掘,找到輸入自己的數據寶藏。

 

 

責任編輯:樂偉
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