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GEO NCBI數據下載與提取視頻教程

時間:2017-08-16 10:01來源:原創 作者:BioWolf 點擊:
生信自學網提供GEO芯片數據下載視頻教程,學習生物信息學,視頻教程更容易入門,操作更簡單,希望對初級學員有幫助。
GEO NCBI數據庫可以免費下載很多芯片數據,包括基因表達芯片,miRNA表達芯片,甲基化芯片,需要做差異分析,選擇GEO數據庫下載芯片數據是一個不錯的選擇。
在數據檢索之前,我們需要知道自己研究的方向,這個方向有哪些關鍵字,做到心中有數,進入數據庫可以檢索相關數據,檢索到數據之后就可以下載。
在芯片選擇是需要注意一些問題,首先是芯片的時間,不能是很久以前的芯片,最好選擇2010年以后的芯片數據,芯片樣本,樣本不要選擇太少的,樣本數目對后續差異分析非常關鍵,一般樣本包括正常和Tumor;芯片平臺,查看芯片品臺,選擇常用的平臺,每個平臺使用的基因ID有所不同,選擇合適的平臺,后續分析少很多工作,有些平臺是直接用gene symbol,而有些用的是Ensembl ID,那么差異分析之前還要做ID轉換。


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責任編輯:樂偉
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